MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium botulinum A2 str. Kyoto chromosome

Total Repeats: 119581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012563	T	7	7	5	11	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012563	TA	3	6	17	22	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012563	T	7	7	47	53	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012563	CAA	2	6	54	59	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012563	ATAA	2	8	73	80	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012563	TA	3	6	83	88	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012563	GTT	2	6	91	96	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012563	GGA	2	6	144	149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012563	AATA	2	8	192	199	75 %	25 %	0 %	0 %	226947223
10	NC_012563	AAGT	2	8	221	228	50 %	25 %	25 %	0 %	226947223
11	NC_012563	AAT	2	6	271	276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947223
12	NC_012563	TTAC	2	8	361	368	25 %	50 %	0 %	25 %	226947223
13	NC_012563	A	7	7	372	378	100 %	0 %	0 %	0 %	226947223
14	NC_012563	ACT	2	6	400	405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226947223
15	NC_012563	GAA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947223
16	NC_012563	A	6	6	410	415	100 %	0 %	0 %	0 %	226947223
17	NC_012563	A	7	7	419	425	100 %	0 %	0 %	0 %	226947223
18	NC_012563	ATA	2	6	428	433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947223
19	NC_012563	ATG	2	6	458	463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947223
20	NC_012563	CTA	2	6	470	475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226947223
21	NC_012563	GCA	2	6	538	543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226947223
22	NC_012563	TAGCAG	2	12	548	559	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	226947223
23	NC_012563	TTTA	2	8	585	592	25 %	75 %	0 %	0 %	226947223
24	NC_012563	TA	3	6	591	596	50 %	50 %	0 %	0 %	226947223
25	NC_012563	TGG	2	6	597	602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226947223
26	NC_012563	ATGC	2	8	628	635	25 %	25 %	25 %	25 %	226947223
27	NC_012563	TA	3	6	646	651	50 %	50 %	0 %	0 %	226947223
28	NC_012563	AGT	2	6	675	680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947223
29	NC_012563	TCT	2	6	688	693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226947223
30	NC_012563	AATT	3	12	710	721	50 %	50 %	0 %	0 %	226947223
31	NC_012563	GAT	2	6	730	735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947223
32	NC_012563	AAAT	2	8	753	760	75 %	25 %	0 %	0 %	226947223
33	NC_012563	TGA	2	6	786	791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947223
34	NC_012563	AGAA	2	8	813	820	75 %	0 %	25 %	0 %	226947223
35	NC_012563	AACA	2	8	865	872	75 %	0 %	0 %	25 %	226947223
36	NC_012563	AAT	2	6	873	878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947223
37	NC_012563	AGA	2	6	918	923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947223
38	NC_012563	A	6	6	1006	1011	100 %	0 %	0 %	0 %	226947223
39	NC_012563	TA	4	8	1052	1059	50 %	50 %	0 %	0 %	226947223
40	NC_012563	TAA	2	6	1103	1108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947223
41	NC_012563	TAG	2	6	1112	1117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947223
42	NC_012563	TCA	2	6	1123	1128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226947223
43	NC_012563	TAA	2	6	1134	1139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947223
44	NC_012563	AAAC	2	8	1192	1199	75 %	0 %	0 %	25 %	226947223
45	NC_012563	ATT	2	6	1219	1224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947223
46	NC_012563	AAG	2	6	1226	1231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947223
47	NC_012563	TAT	2	6	1243	1248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947223
48	NC_012563	AGA	2	6	1260	1265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947223
49	NC_012563	AGA	2	6	1279	1284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947223
50	NC_012563	GAA	2	6	1366	1371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947223
51	NC_012563	TAC	2	6	1389	1394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226947223
52	NC_012563	TAA	2	6	1422	1427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947223
53	NC_012563	A	7	7	1431	1437	100 %	0 %	0 %	0 %	226947223
54	NC_012563	TAAA	2	8	1469	1476	75 %	25 %	0 %	0 %	226947223
55	NC_012563	AAAAAT	2	12	1487	1498	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	226947223
56	NC_012563	TAA	2	6	1515	1520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012563	TTAT	2	8	1525	1532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012563	TTG	2	6	1533	1538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012563	ATT	2	6	1611	1616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012563	TTA	2	6	1656	1661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012563	CAA	2	6	1668	1673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012563	CTA	6	18	1677	1694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012563	TAT	2	6	1698	1703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012563	TCTATT	2	12	1708	1719	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_012563	TAA	2	6	1737	1742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012563	AGG	2	6	1743	1748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012563	A	7	7	1773	1779	100 %	0 %	0 %	0 %	226947224
68	NC_012563	TAT	2	6	1842	1847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947224
69	NC_012563	TTA	2	6	1857	1862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947224
70	NC_012563	TAA	2	6	1867	1872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947224
71	NC_012563	AGA	2	6	1942	1947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947224
72	NC_012563	ATA	2	6	1985	1990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947224
73	NC_012563	AAAT	2	8	2016	2023	75 %	25 %	0 %	0 %	226947224
74	NC_012563	AGA	2	6	2029	2034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947224
75	NC_012563	ATA	2	6	2048	2053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947224
76	NC_012563	AT	4	8	2078	2085	50 %	50 %	0 %	0 %	226947224
77	NC_012563	TAT	2	6	2113	2118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947224
78	NC_012563	A	6	6	2158	2163	100 %	0 %	0 %	0 %	226947224
79	NC_012563	TAG	2	6	2259	2264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947224
80	NC_012563	AAG	2	6	2290	2295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947224
81	NC_012563	GTT	2	6	2300	2305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226947224
82	NC_012563	GATAAT	2	12	2306	2317	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226947224
83	NC_012563	AGA	3	9	2371	2379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947224
84	NC_012563	TTTA	2	8	2419	2426	25 %	75 %	0 %	0 %	226947224
85	NC_012563	AAT	2	6	2443	2448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947224
86	NC_012563	ATT	2	6	2455	2460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947224
87	NC_012563	TTA	2	6	2472	2477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947224
88	NC_012563	GAA	2	6	2498	2503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947224
89	NC_012563	ATA	2	6	2516	2521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947224
90	NC_012563	CT	3	6	2560	2565	0 %	50 %	0 %	50 %	226947224
91	NC_012563	AAG	2	6	2574	2579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947224
92	NC_012563	GAT	2	6	2612	2617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947224
93	NC_012563	TAA	2	6	2625	2630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947224
94	NC_012563	GAA	2	6	2660	2665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947224
95	NC_012563	AGT	2	6	2774	2779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947224
96	NC_012563	TAT	2	6	2791	2796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947224
97	NC_012563	A	6	6	2797	2802	100 %	0 %	0 %	0 %	226947224
98	NC_012563	AAT	2	6	2852	2857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947224
99	NC_012563	AATT	2	8	2893	2900	50 %	50 %	0 %	0 %	226947225
100	NC_012563	ATA	2	6	2906	2911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947225
101	NC_012563	TTCT	2	8	2920	2927	0 %	75 %	0 %	25 %	226947225
102	NC_012563	CAA	2	6	2943	2948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226947225
103	NC_012563	T	6	6	2969	2974	0 %	100 %	0 %	0 %	226947225
104	NC_012563	AAGTTA	2	12	2988	2999	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226947225
105	NC_012563	A	6	6	3012	3017	100 %	0 %	0 %	0 %	226947225
106	NC_012563	GAC	2	6	3041	3046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226947225
107	NC_012563	TAA	2	6	3058	3063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947225
108	NC_012563	ATT	2	6	3077	3082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947225
109	NC_012563	ATT	2	6	3087	3092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012563	TA	3	6	3101	3106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012563	AAT	2	6	3114	3119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012563	A	6	6	3127	3132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012563	TAT	2	6	3133	3138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012563	TAAT	2	8	3143	3150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012563	TA	3	6	3167	3172	50 %	50 %	0 %	0 %	226947226
116	NC_012563	A	6	6	3172	3177	100 %	0 %	0 %	0 %	226947226
117	NC_012563	TAA	2	6	3186	3191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
118	NC_012563	ATG	2	6	3204	3209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947226
119	NC_012563	CAAATA	2	12	3231	3242	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	226947226
120	NC_012563	TAA	2	6	3253	3258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
121	NC_012563	TA	3	6	3289	3294	50 %	50 %	0 %	0 %	226947226
122	NC_012563	ATAAAG	2	12	3327	3338	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226947226
123	NC_012563	ATA	2	6	3360	3365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
124	NC_012563	AT	3	6	3420	3425	50 %	50 %	0 %	0 %	226947226
125	NC_012563	A	6	6	3437	3442	100 %	0 %	0 %	0 %	226947226
126	NC_012563	TAAA	2	8	3453	3460	75 %	25 %	0 %	0 %	226947226
127	NC_012563	ATAAAA	2	12	3461	3472	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	226947226
128	NC_012563	A	8	8	3469	3476	100 %	0 %	0 %	0 %	226947226
129	NC_012563	TGT	2	6	3502	3507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226947226
130	NC_012563	AGA	2	6	3520	3525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947226
131	NC_012563	AAT	2	6	3532	3537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
132	NC_012563	TAT	2	6	3602	3607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947226
133	NC_012563	ATA	2	6	3624	3629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
134	NC_012563	GAAA	2	8	3641	3648	75 %	0 %	25 %	0 %	226947226
135	NC_012563	A	6	6	3658	3663	100 %	0 %	0 %	0 %	226947226
136	NC_012563	ATG	2	6	3699	3704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947226
137	NC_012563	AG	3	6	3739	3744	50 %	0 %	50 %	0 %	226947226
138	NC_012563	TAAAT	2	10	3760	3769	60 %	40 %	0 %	0 %	226947226
139	NC_012563	ATT	2	6	3770	3775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947226
140	NC_012563	AAG	2	6	3791	3796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947226
141	NC_012563	AGA	2	6	3811	3816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947226
142	NC_012563	ATT	2	6	3871	3876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947226
143	NC_012563	A	7	7	3898	3904	100 %	0 %	0 %	0 %	226947226
144	NC_012563	GA	3	6	3911	3916	50 %	0 %	50 %	0 %	226947226
145	NC_012563	GAT	2	6	3944	3949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947226
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150	NC_012563	A	6	6	4051	4056	100 %	0 %	0 %	0 %	226947226
151	NC_012563	ATA	2	6	4058	4063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
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156	NC_012563	TAAAA	2	10	4240	4249	80 %	20 %	0 %	0 %	226947226
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159	NC_012563	GGAT	2	8	4398	4405	25 %	25 %	50 %	0 %	226947227
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161	NC_012563	AT	3	6	4474	4479	50 %	50 %	0 %	0 %	226947227
162	NC_012563	AGG	2	6	4548	4553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_012563	ATG	2	6	4585	4590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947228
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171	NC_012563	TGT	2	6	4931	4936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226947228
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174	NC_012563	AT	3	6	5067	5072	50 %	50 %	0 %	0 %	226947228
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180	NC_012563	TGA	2	6	5294	5299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947228
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182	NC_012563	T	6	6	5362	5367	0 %	100 %	0 %	0 %	226947228
183	NC_012563	CAG	2	6	5524	5529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226947228
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185	NC_012563	TAG	2	6	5620	5625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947228
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187	NC_012563	ATA	2	6	5673	5678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947228
188	NC_012563	AG	3	6	5709	5714	50 %	0 %	50 %	0 %	226947228
189	NC_012563	AGA	2	6	5742	5747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947228
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192	NC_012563	ATTT	2	8	5823	5830	25 %	75 %	0 %	0 %	226947228
193	NC_012563	GAA	2	6	5869	5874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947228
194	NC_012563	AATG	2	8	5915	5922	50 %	25 %	25 %	0 %	226947228
195	NC_012563	TTGATA	2	12	6010	6021	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	226947228
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197	NC_012563	AAT	2	6	6038	6043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947228
198	NC_012563	ACTTT	2	10	6084	6093	20 %	60 %	0 %	20 %	226947228
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200	NC_012563	ACC	2	6	6155	6160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226947228
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202	NC_012563	A	6	6	6183	6188	100 %	0 %	0 %	0 %	226947228
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268	NC_012563	AGA	2	6	8680	8685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947229
269	NC_012563	AGA	2	6	8757	8762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947229
270	NC_012563	TGA	2	6	8763	8768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947229
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